分散型Mini BlogのMastodonでは、それぞれのサーバー上に構築されたMastodonをインスタンスと呼んでいましたが、これをサーバーに名称変更すると言う話があるようです。

～　関連ニュース　～
・Rename from instance to server by mayaeh · Pull Request #9938 · tootsuite/mastodon · GitHub

次のアップデートでは、下記の「このインスタンスについて」の部分も「このサーバーについて」に変わるのでしょうか。

それとも、名称変更するかどうかは、各インスタンス（サーバー）の管理者に任されるのでしょうか。

別にインスタンスでもいいと思いますが、よりわかりやすくということなんでしょうね。
個人的には「箪笥」という呼び方が好きです。（インスタンスから）
しーゆー。